Henk van Putten is geboren in 1940. Zijn eerste orgelles kreeg hij van zijn vader. Later werd Klaas Jan Mulder zijn leermeester, ook voor piano.
Henk van Putten werd organist van de Hervormede Kerk te IJsselmuiden. Deze functie heeft hij neergelegd toen hij 1e organist werd in de Broederkerk (1975). Tevens is hij 2e organisten van de Bovenkerk.